Les herbiers sont étroitement liés aux milieux voisins que sont la mangrove et le récif corallien. En effet, les phanérogames des herbiers sont des espèces qui ont une activité photosynthétique, ce qui signifie qu’elles élaborent de la matière organique (constituant de la matière vivante) à partir d’élément minéraux, de gaz carbonique et en utilisant l’énergie solaire. Ce sont donc les piliers des écosystèmes qui produisent les éléments nécessaires au développement de la vie. Ils sont une source de matière organique (débris de feuilles et de racines par exemple), un filtre naturel de l’eau, ils régulent l’érosion et stabilisent les sédiments, les empêchant d’aller étouffer les coraux. Ils séquestrent du carbone et produisent de l’oxygène. Ils permettent donc le maintien global d’un bon état de l’écosystème côtier.